岩石显微图像专题 II 区论文(已发表) 版本 ZH2 Vol 5 (3) 2020
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《岩石显微图像专题》卷首语
: 2020 - 09 - 16
: 2020 - 09 - 30
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数据是科学发现的源泉和基石。现代自然科学是建立在数据基础上的实证科学,离开数据,就谈不上科学的发展。长期以来由于传播媒介和技术的局限性,科学家的研究成果仅能以主要证据和结论的方式在专著、会议论文或期刊论文等载体上发表,而在科学研究过程中产生的大量直接或间接的数据多被埋没,甚至丢弃,这是一种极大的资源浪费。随着科学技术的快速发展,科学大数据呈现爆发式增长[1]。同时,信息技术的飞速发展,存储和传播的成本一再下降,使得数据和信息的存储、传播所所面临的容量桎梏、时间和空间藩篱逐渐打破,科学数据的公开和分享的技术瓶颈被攻克,操作也变得简单易行。
科学数据共享是科技进步的新动力和社会发展的重要需求。科学数据的共享,一方面可以提高研究结果的可检验性和公信力,另一方面能够扩展科学研究的范围,拓宽科学研究的视角,产生更多的科学知识,还可以为科研以外的生产活动进行开发和利用,产生难以预料的社会和经济价值[2]。正是由于科学数据共享的巨大价值,如何保存、利用科学大数据已经成为全世界科学家所关注的热点问题,也得到各国政府、资助机构、出版机构、科研单位、公众等关注和推动。
鉴于地球系统的高度复杂性,其研究方法和指标体系纷繁庞杂,数据以多种形式呈现,如图形图像、文字描述、数据表格等。长期以来,由于缺乏统一、高效的地质数据存储标准和机制,海量的地质数据散布在出版物中,或者分散地储存在研究者手中,不但无法整合利用,甚至面临消失的风险。正如张旗先生和周永章教授[3]所言:“在大数据时代,地质观测、野外考察能否被数据化,非结构化数据能否转变为结构化数据,是地质能否进入大数据时代科学殿堂的关键。”地质大数据具有多源(元)异构、时空相关性、复杂性与模糊性、地质体的全球性与国家利益等鲜明特点[4]。蓬勃发展的大数据科学为典型的数据密集型学科——地质学带来了前所未有的机遇与挑战。
长期以来,科学家对岩石显微图像并没有形成统一的标准,迄今也没有统一规格的岩石显微图像数据库。科学家或者科研团队多根据自己的需要和目标来拍摄少量的图像,置于学术论文中或者存放到网络上,作为科研成果的一部分或者教学材料。随着近年来数字图像技术大发展,大规模拍摄和存储岩石显微图像成为了可能。“深时数字地球”(DDE)是由我国科学家发起的国际大科学计划,以“整合地球演化全球数据、共享全球地学知识”为使命,以推动地球科学研究范式的变革为愿景。出于“抢救”数据、促进数据共享和高效利用的目的,由沉积学工作组和古地理工作组发起,与国内沉积学界、古地理学界同行共同协商,特组织出版《岩石显微图像专题》,面向国内外同仁征集符合标准的岩石显微图像数据成果。专题内容包括且不限于:1)项目产生和获取的未发表的岩石样品显微图像数据集;2)岩石教学样品显微图像数据集;3)已公开发表过的文章中涉及的岩石样品显微图像数据集;4)团队或个人收集的岩石样本显微图像数据集。
不积跬步,无以至千里。通过本专题的组织和出版,一方面积累一批统一标准的、高质量的岩石显微图像集,另一方面也是探索地学暗数据的发掘与共享模式。我们期望并号召地学界的同仁,用实际行动投入到地质大数据的共享和利用中来。人人分享数据,人人受益数据。用小小的行动来探索地学数据的共享机制,扩大基础研究数据的深化研究与应用。
本专题包括1篇沉积岩显微图像数据库标准和21篇数据论文。这些数据涵盖了青藏高原、塔里木板块、华南板块、华北板块等太古代以来(约26亿年至现代)的12类岩石5328个岩石样本(图1,表1)。每一个样本包括每一个薄片的显微图像以及基本特征描述。本专题含27张岩石薄片信息表、46个压缩包、19 333张显微照片,数据量超过110 GB。这些岩石样本涉及超过62个岩石单元的129个剖面或钻孔,样品分布在中国的28个省(区、直辖市)以及捷克波西米亚省(表2)。


图1   《岩石显微图像专题》收录的岩石样品类型与数量
表1   《岩石显微图像专题》收录的岩石样品情况
岩类砂岩砾岩粉砂岩泥页岩火山碎屑岩混积岩灰岩白云岩其他内源沉积岩侵入岩火山岩变质岩汇总
数量152377141913518625243205481641885328
表2   《岩石显微图像专题》岩石样品地理分布情况
省份岩石样品数省份岩石样品数
西藏2109北京24
新疆706甘肃16
山西468广西16
陕西395贵州16
四川350云南14
河南193江西12
安徽155湖南6
江苏138吉林3
山东320辽宁3
湖北113宁夏3
内蒙古81青海3
浙江57台湾3
重庆56天津3
河北45捷克波西米亚省3
福建27
面向大数据时代,本专题数据集建设的目的是便于人机共用,既方便人类读取与使用,也利于计算机去读取与利用。前者很好理解,科学家需要更多的数据集来开展对比研究,来用于教学与大众科普;后者是指伴随着图像技术和人工智能技术的蓬勃发展,基于显微图像的交叉研究成为了可能。实现这种计算机和地质学交叉研究模式的一个重要前提就是要求一定数量的数据集和统一的标准和信息录入格式,这样才能更有效地实现这些数据的整合。从这个意义来讲,本专题数据集丰富了岩石显微图像数据库,一批高质量的图像数据不仅可以满足地学研究人员的需要,也为机器学习与地质学的交叉研究提供了重要的数据样本。此外,这些岩石显微图像不仅可以作为大众科普教育的素材,成为大众了解地球奥秘的窗口之一,也可以直接用于图像密码或图像验证码的素材,而一些独特且具有神秘色彩的显微照片更是具有一定的艺术观赏与猎奇的价值。
感谢《中国科学数据》期刊对《岩石显微图像专题》的支持,特别感谢各数据论文作者的悉心整理和专题编辑的严谨工作。专题得以面世是期刊主编和编委、编辑部、审稿人、作者共同努力的结果。希望岩石显微图像数据集的出版能起到抛砖引玉的作用。衷心希望有更多的地质数据集得以出版,更多的地质暗数据被发掘与共享。只有高质量的地质大数据不断积累,地质学拥抱数据科学才有可能。相信,这一天不会太远。
附录1  
序号论文标题作者构造分区或地区样品形成时代剖面或钻孔数涉及地层单元数量样品数/显微图片总数/鉴定表/压缩数据包/数据量/GB
1南京大学岩石教学薄片显微图像数据集赖文等中国各地和捷克未知3272647334.95
2雅鲁藏布江砂粒显微图像数据集董小龙等雅鲁藏布江现代1218762210.23
3藏南特提斯喜马拉雅带晚白垩世–早古近纪碳酸盐岩显微图像数据集李娟等特提斯喜马拉雅晚白垩世–始新世54506890449.35
4新疆塔里木盆地西部晚白垩世–始新世岩石薄片偏光显微图像数据集张世杰等塔里木盆地西部晚白垩世–始新世697401364142.05
5北拉萨地体白垩纪郎山组岩石薄片显微图像数据集许艺炜等北拉萨地体白垩纪中期3156311341425.06
6藏南日喀则弧前盆地白垩纪陆源碎屑岩显微图像数据集张艺秋等日喀则弧前盆地白垩纪中期103191388138.9
7拉萨地体中–北部白垩纪陆源碎屑岩显微图像数据集赖文等拉萨地体中北部白垩纪中期225402876133.03
8鄂尔多斯盆地东北缘中侏罗世碎屑岩显微图像数据集晁晖等鄂尔多斯盆地东北缘中侏罗世2279516125.02
9西藏特提斯喜马拉雅早–中侏罗世岩石薄片偏光显微图像数据集韩中等特提斯喜马拉雅早–中侏罗世234961026128.64
10中扬子区中生代含变质岩屑砂岩的显微图像数据集马千里等中扬子地区三叠纪–侏罗纪7686289110.81
11上扬子西北缘飞仙关组碳酸盐岩显微图像数据集柴寒冰等上扬子西北缘早三叠世413301082111.49
12鄂尔多斯盆地东北缘上古生界盒8段砂岩显微图像数据集史格等鄂尔多斯盆地东北部晚二叠世112801144143.96
13中国西南地区二叠纪含火山岩屑砂岩的显微图像数据集冯薇等中国西南地区二叠纪1143318110.86
14鄂尔多斯盆地东缘临兴区块上古生界致密砂岩显微图像数据集李盼盼等鄂尔多斯盆地东缘临兴区块石炭纪–二叠纪246305660115.67
15南华北石炭–二叠纪太原组灰岩显微图像数据集马睿等华北板块南缘石炭纪–二叠纪3195380131.98
16下扬子南部上泥盆统–下石炭统五通群陆源碎屑岩显微图像数据集蔡文鹏等下扬子地区晚泥盆世–早石炭世121212856113.17
17塔西北与华南地区晚奥陶世碳酸盐岩(含生物碎屑)显微图像数据集常晓琳等塔里木盆地与华南地区晚奥陶世27140348121.97
18鲁西九龙山剖面寒武系苗岭统–芙蓉统之交碳酸盐岩显微图像数据集辛浩等华北台地东部中–晚寒武世12104825120.32
19鄂尔多斯盆地中寒武统徐庄组岩石薄片显微图像数据集钱红杉等鄂尔多斯盆地周缘中寒武世91192836111.98
20上扬子西北缘震旦系灯影组碳酸盐岩显微图像数据集齐哲等上扬子西北缘震旦纪231191335116.74
21渤海湾盆地渤中凹陷潜山及上覆砂砾岩显微图像数据集刘彦鹏等华北渤海湾太古代、新生代26116543114.06
汇总129625328193332746110.24
附录1(续)  
序号论文标题作者岩类及数量汇总/个
砂岩砾岩粉砂岩泥页岩火山碎屑岩混积岩灰岩白云岩其他内源沉积岩侵入岩火山岩变质岩
1南京大学岩石教学薄片显微图像数据集赖文等180612150153157545123327
2雅鲁藏布江砂粒显微图像数据集董小龙等0000000000002
3藏南特提斯喜马拉雅带晚白垩世–早古近纪碳酸盐岩显微图像数据集李娟等10000341580000506
4新疆塔里木盆地西部晚白垩世–始新世岩石薄片偏光显微图像数据集张世杰等54066911004361411000740
5北拉萨地体白垩纪郎山组岩石薄片显微图像数据集许艺炜等0000004461130030563
6藏南日喀则弧前盆地白垩纪陆源碎屑岩显微图像数据集张艺秋等159112510107140191
7拉萨地体中–北部白垩纪陆源碎屑岩显微图像数据集赖文等2501526018265063125402
8鄂尔多斯盆地东北缘中侏罗世碎屑岩显微图像数据集晁晖等6008100000000079
9西藏特提斯喜马拉雅早–中侏罗世岩石薄片偏光显微图像数据集韩中等1700007040430000496
10中扬子区中生代含变质岩屑砂岩的显微图像数据集马千里等833000000000086
11上扬子西北缘飞仙关组碳酸盐岩显微图像数据集柴寒冰等000000295350000330
12鄂尔多斯盆地东北缘上古生界盒8段砂岩显微图像数据集史格等28000000000000280
13中国西南地区二叠纪含火山岩屑砂岩的显微图像数据集冯薇等430000000000043
14鄂尔多斯盆地东缘临兴区块上古生界致密砂岩显微图像数据集李盼盼等30500000000000305
15南华北石炭–二叠纪太原组灰岩显微图像数据集马睿等000000950000095
16下扬子南部上泥盆统–下石炭统五通群陆源碎屑岩显微图像数据集蔡文鹏等13418154400000001212
17塔西北与华南地区晚奥陶世碳酸盐岩(含生物碎屑)显微图像数据集常晓琳等00000014000000140
18鲁西九龙山剖面寒武系苗岭统–芙蓉统之交碳酸盐岩显微图像数据集辛浩等00000010400000104
19鄂尔多斯盆地中寒武统徐庄组岩石薄片显微图像数据集钱红杉等1801010011108350000192
20上扬子西北缘震旦系灯影组碳酸盐岩显微图像数据集齐哲等000000010915000119
21渤海湾盆地渤中凹陷潜山及上覆砂砾岩显微图像数据集刘彦鹏等1013081000002059116
汇总152377141913518625243205481641885328
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郭华东. 科学大数据——国家大数据战略的基石[J]. 中国科学院院刊, 2018, 33(8): 768-773.
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郭华东. 问渠哪得清如许, 为有源头活水来——《中国科学数据》发刊词[J/OL].中国科学数据, 2016, 1(1). DOI:10.11922/csdata.0.2016.0014.
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张旗, 周永章. 大数据助地质腾飞: 岩石学报2018第11期大数据专题“序”[J]. 岩石学报, 2018, 34(11): 3167-3172.
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翟明国, 杨树锋, 陈宁华, 等. 大数据时代: 地质学的挑战与机遇[J]. 中国科学院院刊, 2018, 33(8): 825-831.
稿件与作者信息
论文引用格式
胡修棉, 侯明才, 赖文. 《岩石显微图像专题》卷首语[J/OL]. 中国科学数据, 2020, 5(3). (2020-09-29). DOI: 10.11922/csdata.2020.0088.zh.
胡修棉
Hu Xiumian
huxm@nju.edu.cn
1. 南京大学地球科学与工程学院,内生金属矿床成矿机制研究国家重点实验室
侯明才
Hou Mingcai
2. 成都理工大学沉积地质研究院 3. 油气藏地质及开发工程国家重点实验室(成都理工大学)
赖文
Lai Wen
1. 南京大学地球科学与工程学院,内生金属矿床成矿机制研究国家重点实验室
出版历史
II区出版时间:2020年9月30日 ( 版本ZH2
最近更新时间:2020年9月30日 ( 版本ZH4
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中国科学数据
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