中国生物多样性数据集专题 I 区论文(评审中) 版本 ZH2
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滇西北县域种子植物名录数据集
The catalogue of county-level seed plants in Northwest Yunnan
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: 2020 - 04 - 22
: 2020 - 04 - 30
: 2020 - 04 - 30
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摘要&关键词
摘要:滇西北处于全球生物多样性热点地区之一横断山的南端,植物多样性丰富,然而植物空间分布数据仍较为欠缺,没有县域分布数据。通过整合涉及滇西北的植物志书、野外科考报告、区域性生物多样性专著、国内外分类学学术期刊发表的新类群和新记录、各大标本馆及公共数据库等资料,参照最新的分子系统学和分类学成果,构建滇西北县域种子植物名录数据集。本数据集由滇西北16个县的县域被子植物和裸子植物物种名录组成,包含拉丁目名、中文目名、拉丁科名、中文科名、学名、中文名、县级分布7个类型字段信息,共5447种。本名录可以为滇西北丰富的种子植物多样性的研究和保护提供数据支持。
关键词:滇西北;种子植物;县域;名录
Abstract & Keywords
Abstract: Northwest Yunnan locates in the south part Hengduan Mountains, which is one of the global biodiversity hotspot. This region possess rich plant diversity, but plant distribution data (especially county-level) is far from sufficient. In this study, we archived a catalogue of county level seed plants in Northwest Yunnan using latest taxonomic system, through integration of literature (existing floras, books, new species and new records), specimen and public database involve Northwest Yunnan. This dataset consist of checklist of 5,447 seed plants species of the 16 county of Northwest Yunnan, including seven parts of data: order name in Latin, order name in Chinese, family name in Latin, family name in Chinese, scientific name, Chinese name and distribution data of county-level. This dataset has research value and will potentially facilitate conservation of rich seed plants species in Northwest.
Keywords: Northwest Yunnan; seed plants;  county-level; catalogue
数据库(集)基本信息简介
数据库(集)名称滇西北县域种子植物名录数据集
数据作者李文庆、尹昭吉、陈凯云、陈家辉
数据通信作者陈家辉(chenjh@mail.cn)
数据时间范围1400–2019年
地理区域滇西北(24°38′–29°15′N,98°05′–101°16′E),其中包括:隆阳区、腾冲县、泸水县、福贡县、贡山县、维西县、兰坪县、云龙县、剑川县、洱源县、大理市、漾濞县、玉龙县、香格里拉市、德钦县、宁蒗县。
空间分辨率县级
数据量787 KB,合计总数据量20,467万条
数据格式*.xlsx
数据服务系统网址http://www.sciencedb.cn/dataSet/handle/979
基金项目生态环境部,生物多样性调查评估项目(2019HJ2096001006)
数据库(集)组成数据集包括滇西北地区种子植物68目194科1158属5447种,其中被子植物63目188科1146属5427种(含种下等级),裸子植物5目6科12属20种(含种下等级)。数据内容由7部分组成,分别为拉丁目名、中文目名、拉丁科名、中文科名、学名、中文名、县级分布。
Dataset Profile
TitleThe catalogue of seed plants in Northwest Yunnan Province
Data corresponding authorChen Jiahui (chenjh@mail.kib.ac.cn)
Data author(s)Li Wenqing, Yin Zhaoji, Chen Kaiyun, Chen Jiahui
Time range1400 – 2019
Geographical scope24°38’N – 29°15’N, 98°05’E – 101°16’E, specific areas include: Longyang district, Tengchong county, Lushui county, Fugong county, Gongshan county, Weixi county, Lanping county, Yunlong county, Jianchuan county, Eryuan county, Dali county, Yangbi county, Yulong county, Shangri-la county, Deqin county, Ninglang county
Spatial resolutionCounty-level
Data volume787 KB, with 20,467 data entries in total
Data format*.xlsx
Data service system<http://www.sciencedb.cn/dataSet/handle/979>
Source(s) of fundingThe Biodiversity Survey and Assessment Project of the Ministry of Ecology and Environment, China (2019HJ2096001006).
Dataset/Database compositionThis dataset covers seed plants of 5,447 species (including infraspecies) affiliated to 1,158 genera, 194 families under 68 orders, including 5,427 species of angiosperms affiliated to 1,146 genera, 188 families under 63 orders, and 20 species of gymnosperms affiliated to 12 genera, 6 families under 5 orders. The dataset includes information on the plants’ order name in Latin, order name in
Chinese, family name in Latin, family name in Chinese, species name in Latin, species name in Chinese and County-level distribution.
引 言
滇西北地处青藏高原南缘,属于横断山的南端,特殊的地质地貌、复杂多样的气候类型与纵横交错的河网水系,使该地区成为我国乃至世界生物多样性丰富和独特的地区之一[1]。该地区位于云南省西北部,在行政区划上包括迪庆藏族自治州、怒江傈僳族自治州、丽江市、保山市和大理白族自治州。在2010年9月17日发布的《中国生物多样性保护战略与行动计划》 (2011−2030年)中,滇西北被认为是8个优先保护区域之一的西南高山峡谷区的主要组成区域。此外,在《中国的生物多样性:现状及其保护对策》[2]一书中提出的我国14个具有国际意义的陆地生物多样性关键地区中就包括滇西高山峡谷地区。滇西北面积为79800 km2,占比不到国土面积的1%,却拥有全国约三分之一的高等植物,然而生物多样性空间分布数据却十分欠缺[3]
生物物种名录是一个自然地理区域或行政单元的生物区系本底性的基础资料[4],物种名录的编目是一个需要及时更新的动态过程。2006年完成的《云南植物志》[5]、2004年完成的《中国植物志》[6]和2013年完成的第二版《Flora of China》(50卷)[7],反映了学者们对云南包括滇西北地区高等植物认识的阶段性成就,在一定程度上补充和完善了对云南植物物种多样性的认识。然而,区域性(滇西北等)生物多样性评估非常有限,物种精确的分布、状态和变化趋势大都不清楚[8-9]。加之随着近年来对滇西北地区生物多样性调查和研究的深入,大量的新分类群和新记录物种的发现和发表,以及分类学和系统学的深入研究导致大量科、属和种范围界定和系统位置发生变化等原因[10],编制滇西北种子植物名录并建立及时更新制度与平台对于区域性生物多样性研究和保护与利用实践都是十分重要的。
1   数据采集和处理方法
1.1   数据源
滇西北县域种子植物名录数据集的来源主要包括以下4种:
(1)该区域的植物志书和区域性生物多样性专著:如《中国生物多样性红色名录—高等植物卷》、《中国生物物种名录(2019版)》、《中国植物志》、《Flora of China》、《中国珍稀濒危保护植物名录》、《国家重点保护野生植物名录》、《云南植物志》、《云南省生物物种名录(2016版)》、《云南生物物种红色名录(2017版)》、《云南种子植物名录》、《青藏高原维管植物及其生态地理分布》和《横断山区维管植物》等。
(2)文献:国内外分类学学术期刊发表的涉及到滇西北区域的类群的分类学修订以及该区域有分布的新类群和新记录。
(3)标本馆及公共数据库:收集中国科学院昆明植物研究所标本馆(KUN)、中国科学院植物研究所标本馆(PE)、中国科学院成都生物研究所植物标本馆(CDBI)、四川大学植物标本馆(SZ)、中国科学院西北高原生物研究所植物标本馆(QTPMB)、西藏高原生物研究所标本馆、云南大学标本馆(PYU)等高校和科研院所滇西北高等植物的馆藏标本信息,以及中国数字植物标本馆(CVH,http://www.cvh.org.cn),中国国家标本资源平台(NSII,http://www.nsii.org.cn/),全球生物多样性信息网络(GBIF,https://www.gbif.org/)等分类学公共网络数据平台的滇西北高等植物的标本信息。
(4)补充和更新近年的野外考察成果和专家建议的观点。
将通过以上各种数据源整合得到的种子植物名录和地理分布的集合数据录入EXCEL,以方便后面处理。
1.2   数据处理
(1)异名处理
通过分类学名称解析系统(Taxonomic Name Resolution Service, TNRS, http://tnrs.iplantcollaborative.org/)[11]平台对整合的种子植物名录集合数据中的科名和学名进行核对,TNRS数据库数据来源于Tropicos、Global Compositae Checklist、USDA Plants和NCBI Taxonomy[12]。根据匹配结果得分,匹配程度(Over score)低于0.9的学名参考《中国植物志》、The Plant List (http://www.theplantlist.org/)、物种2000(http://www.sp2000.cn/joaen/index.php)、Flora of China(http://www.efloras.org/flora_page.aspx?flora_id=2)等中的物种接受名(Accepted name)进行人工逐一核对和处理。
(2)分类系统
参照最新的分子系统学和分类学成果决定启用的名称和系统位置。近年来,分子系统学研究对科的范畴和系统位置确定有很重要的影响,新的研究结果往往会导致新科属的发表或老的科属名的重新启用,因此我们对科、属范畴的界定尽量参照最新的分子系统学研究成果。裸子植物系统采用Flora of China系统,被子植物系统采用APG Ⅳ系统[10]
(3)种下等级处理
为了细化植物多样性,采用变种或亚种的概念。当一个种的种下有2个以上的亚种或变种,若仅仅是某变种/亚种(包括原变种/亚种)分布于滇西北,则仅收录该变种/亚种[10]
(4)提取地理分布
从上述已经进行异名处理后的种子植物数据集中按照地理分布信息分别提取出隆阳区、腾冲县、泸水县、福贡县、贡山县、维西县、兰坪县、云龙县、剑川县、洱源县、大理市、漾濞县、玉龙县、香格里拉市、德钦县、宁蒗县这16个县域中的被子植物和裸子植物名录数据,最终形成滇西北地区县域种子植物名录数据集。针对历史采集信息,存在许多地点描述不规范和信息缺失的问题,同时考虑我国行政区划在不断发生更替,早期的很多地名已经发生变化[13],因此还进行了手工逐条校对并更正。
(5)中文名选用原则
种选用的中文名主要依据《云南植物志》中物种的中文名称,对于没有记载或者匹配失败的,依次选用《中国生物多样性红色名录·高等植物卷》和《Flora of China》所记载的中文名。
2   数据样本描述
数据集合计总数据量为20467万条,每条目包含一个县级分布地,具体包括滇西北地区种子植物68目194科1158属5447种(含种下等级),其中被子植物63目188科1146属5427种(含种下等级),裸子植物5目6科12属20种(含种下等级)。数据内容由7部分组成,分别为拉丁目名、中文目名、拉丁科名、中文科名、学名、中文名、县级分布(见图1)。


图1   滇西北种子植物数据集
3   数据质量控制和评估
为了对数据质量进行控制和评估,我们采用工作组初审和专家会审和函评的工作流程。初审主要由工作组完成,即根据以上原则对滇西北记录的所有物种名称进行逐一审核。邀请云南省内外有关分类学专家进行专家审核会,专家组成员提出质疑,由工作组成员根据专家意见进行审核和修改。对一些从事专科专属研究的专家,则采用发送邀请函,通过电子邮件的方式邀请专家对相应的科属进行审核。由专家出具书面审核意见和建议。工作组根据专家的审核意见和建议进行修改、调整和完善。
4   数据价值
滇西北是中国西南山地这一全球生物多样性热点地区的核心区域,但其生态环境十分脆弱、经济社会发展相对滞后,进行该区域植物多样性摸底调查对于这一重要区域的生物多样性保护和科学利用是十分必要的。本数据集可以为掌握生物多样性空间分布规律和明确滇西北地区植物保护空缺提供数据支持,为提出优先区域生物多样性的保护与监管对策以及政府决策提供依据和基础资料,为我国未来开展大尺度的生物多样性本底调查与评估提供案例。
致 谢
感谢参与滇西北种子植物名录编目的工作组付出的时间和精力,感谢专家组所有人提供的悉心指导和宝贵建议。
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数据引用格式
李文庆, 尹昭吉, 陈凯云, 陈家辉. 滇西北县域种子植物名录数据集[DB/OL]. Science Data Bank, 2020. (2020-04-22). DOI: 10.11922/sciencedb.979.
稿件与作者信息
论文引用格式
李文庆, 尹昭吉, 陈凯云, 陈家辉. 滇西北县域种子植物名录数据集[J/OL]. 中国科学数据, 2020. (2020-04-27). DOI: 10.11922/csdata.2020.0023.zh.
李文庆
Wenqing Li
主要承担工作:数据收集与分析。
(1990—),女,云南人,硕士,研究实习员,研究方向为植物地理与遥感。
尹昭吉
Zhaoji Yin
主要承担工作:项目管理、数据收集与分析。
(1997—),男,云南人,学士,助理工程师,研究方向为计算机。
陈凯云
Kaiyun Chen
主要承担工作:数据收集与分析。
(1990—),男,云南人,硕士,研究实习员,研究方向为植物分类。
陈家辉
Jiahui Chen
主要承担工作:项目组织、管理与数据审核。主要承担工作:项目管理、数据收集与分析。
chenjh@mail.kib.ac.cn
(1977—),男,江西人,博士,副研究员,研究方向为植物分类学与系统演化。
出版历史
I区发布时间:2020年4月30日 ( 版本ZH2
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中国科学数据
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